拉薩市水利局前身為拉薩市水利水電工程隊，1967年秋至1969年初，市水利水電工程隊劃歸市農牧局管理，1969年初市水利電力工程隊隸屬關系由農牧局劃歸市工業局管理，1969年7月市水利電力工程隊成立了革命領導小組，1970年12月經上級批準，為加強市水電建設正式錄用拉薩中學畢業生46名，1971年7月在堆龍德慶縣桑姆農場成立了拉薩市水利電力工程隊革命領導小組，共計干部職工32人，1972年底拉薩市水利電力工程隊歸市農牧局，1978年更名為拉薩市水利電力設計安裝隊。1984年5月經市委會議研究成立了拉薩市水利電力設計安裝隊，1987年4月在機構改革中，拉薩市水利電力局縣級單位降為區級單位，隸屬市農牧局領導，1996年5月市水利電力局升為副縣級單位，并成立了拉薩市水利勘察規劃設計室，2002年經市政府辦公廳拉政（2002）61號文件批準 ，成立拉薩市水利電力勘察規劃設計院，負責水利項目勘察、規劃、設計前期工作，編制28名實行差額撥款。
    1997年8月在西藏自治區建設廳辦理了工程設計證書資質為丙級，設計院在規定的范圍內完成了較多的水利、水電勘察設計工作。先后完成了拉薩河規劃設計、林周縣農業綜合規劃、林芝縣綜合規劃、日喀則南木林縣電站、林芝縣電站、尼木縣電站、米林縣電站、堆龍德慶縣電站、墨竹工卡日多電站、尼木縣麻江電站、曲水縣茶巴拉干渠、堆龍乃瓊干渠、曲水才納干渠、尼木塔榮灌區、林周縣�，敻汕�、堆龍柳梧節水工程、達孜德慶節水工程。近幾年完成了，尼木縣曲林灌區、尼木縣普松灌區、尼木縣續邁灌區，墨竹工卡開發區防洪堤、林周縣城段防洪堤、拉薩河嘎巴村段應急防洪堤、當雄縣城防洪堤、拉薩河太陽島坍塌段應急整治工程、達孜縣曲尼帕應急整治、尼木縣吞巴小流域綜合治理、曲水尼浦溝小流域綜合治理，八座水庫等中小型水利電力項目的勘察設計工作。
    水利工程勘測、規劃、設計為設計院的主要任務，隨著市場的需求，設計院在不斷加強這方面的力量。近年來，拉薩市水利勘察規劃設計院不僅從相關院校吸收專業人才，還在本隊現有技術人員中加強業務培養，做到了實踐中不斷鍛煉，使之業務人員技能得到一定的提高。目前設計院具有高級工程師4人，工程師4人，助理工程師9人。
    拉薩市水利勘察設計院發展到至今，其勘測、設計力量較為雄厚、設備齊全、管理科學、為西藏的水利事業發揮了應有的作用，作出了較大的貢獻。